（1）产酶耐药株的影响：从前国内临床分离的淋球菌大部分对青霉素敏感，首选青霉素治疗，效果很好，治愈率均在90%以上。但近年来由于青霉素广泛使用，产青霉素的耐药菌株出现，使青霉素在治疗淋病效果方面大大降低，据实验证实，国内耐青霉素淋球菌株发生率已高达50%以上，因此，治疗药物选择，应根据情况做药物敏感试验。

　　（2）用药不足或疗程不够：有些淋病患者由于心理上有羞愧感，不愿到医院就诊，去私人诊所或“游医”处打上几针，症状消失了，自以为病好了（其实是病菌携带者）便中断治疗，以致使用的药物剂量不足或疗程不够或未彻底治愈，从而造成迁延不愈，有些转为慢性淋病，花很多钱，受很多罪还是复发，给治疗带来很大的困难。

　　（3）缺乏性生活常识：淋病病人在急性发作前或治疗期间没有节制性交，使患者一方给另一方传染，夫妇双方又未同时治疗，使病情反复交叉感染是造成药物治疗失败的重要原因。

　　（4）没有同时治疗并发症：淋病病人除尿道炎外，往往合并非淋菌性尿道炎、前列腺炎、精囊炎或宫颈炎、盆腔炎等，要彻底治愈必须在治疗淋病的基础上采用相应措施治疗合并症。否则，细菌或其它病原微生物不能彻底清除是导致疾病迁延不愈反复发作的重要原因。